Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms