Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DbpQ60925 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms