Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprnQ60673 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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