Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabl6Q5U3K5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms