Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan4Q5SZT6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan4Q5SZT6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan4Q5SZT6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms