Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim9Q3V0X1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim9Q3V0X1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim9Q3V0X1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim9Q3V0X1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim9Q3V0X1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim9Q3V0X1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim9Q3V0X1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim9Q3V0X1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim9Q3V0X1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim9Q3V0X1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim9Q3V0X1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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