Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaaf3Q3UYV8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaaf3Q3UYV8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaaf3Q3UYV8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaaf3Q3UYV8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnaaf3Q3UYV8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms