Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fchsd2Q3USJ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fchsd2Q3USJ8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms