Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem253Q3UNB8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms