Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smu1Q3UKJ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smu1Q3UKJ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms