Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b2Q3UJB0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b2Q3UJB0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms