Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnrc6cQ3UHC0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6cQ3UHC0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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