Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms