Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mcrip1Q3UGS4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mcrip1Q3UGS4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms