Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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