Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gse1Q3U3C9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms