Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud5Q3U2S4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud5Q3U2S4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms