Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Hbq1bQ3U0A6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Hbq1bQ3U0A6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms