Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc28Q3TX51 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc28Q3TX51 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms