Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms