Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms