Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hddc2Q3SXD3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms