Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms