Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnnm3Q32NY4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnnm3Q32NY4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm3Q32NY4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms