Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col24a1Q30D77 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col24a1Q30D77 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms