Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4fQ2MDF8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4fQ2MDF8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms