Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 ZDS1YMR273C 2748 nt3.12□□□□□ -1.91
USB1Q12208 ALG1YBR110W 1350 nt3.12□□□□□ -1.91
USB1Q12208 LCB5YLR260W 2064 nt3.12□□□□□ -1.91
USB1Q12208 HCA4YJL033W 2313 nt3.11□□□□□ -1.91
USB1Q12208 RTK1YDL025C 1863 nt3.11□□□□□ -1.91
USB1Q12208 RNT1YMR239C 1416 nt3.11□□□□□ -1.91
USB1Q12208 CPA2YJR109C 3357 nt3.11□□□□□ -1.91
USB1Q12208 YDL071CYDL071C 375 nt3.11□□□□□ -1.91
USB1Q12208 MAF1YDR005C 1188 nt3.11□□□□□ -1.91
USB1Q12208 ERV14YGL054C 417 nt3.11□□□□□ -1.91
USB1Q12208 IDP2YLR174W 1239 nt3.11□□□□□ -1.91
USB1Q12208 SSO2YMR183C 888 nt3.11□□□□□ -1.91
USB1Q12208 PNG1YPL096W 1092 nt3.11□□□□□ -1.91
USB1Q12208 YBR137WYBR137W 540 nt3.11□□□□□ -1.91
USB1Q12208 VFA1YER128W 612 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 OTU1YFL044C 906 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 CLC1YGR167W 702 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 YKE4YIL023C 1041 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 CAP2YIL034C 864 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 AIR1YIL079C 1083 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 TIS11YLR136C 858 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 YLR462WYLR462W 609 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 PSF3YOL146W 585 nt3.1□□□□□ -1.91
USB1Q12208 RSF2YJR127C 4143 nt3.09□□□□□ -1.91
USB1Q12208 ISM1YPL040C 3009 nt3.09□□□□□ -1.91
USB1Q12208 NUP159YIL115C 4383 nt3.09□□□□□ -1.91
USB1Q12208 HDA2YDR295C 2025 nt3.09□□□□□ -1.91
USB1Q12208 DAN1YJR150C 897 nt3.09□□□□□ -1.91
USB1Q12208 YMR147WYMR147W 672 nt3.09□□□□□ -1.91
USB1Q12208 YOR022CYOR022C 2148 nt3.09□□□□□ -1.91
USB1Q12208 RIB5YBR256C 717 nt3.09□□□□□ -1.91
USB1Q12208 CLD1YGR110W 1338 nt3.09□□□□□ -1.91
USB1Q12208 RRN6YBL014C 2685 nt3.09□□□□□ -1.91
USB1Q12208 GPI1YGR216C 1830 nt3.09□□□□□ -1.92
USB1Q12208 FBP26YJL155C 1359 nt3.09□□□□□ -1.92
USB1Q12208 PRS5YOL061W 1491 nt3.09□□□□□ -1.92
USB1Q12208 SLA1YBL007C 3735 nt3.08□□□□□ -1.92
USB1Q12208 NIS1YNL078W 1224 nt3.08□□□□□ -1.92
USB1Q12208 FDH2YPL275W 711 nt3.08□□□□□ -1.92
USB1Q12208 PRE2YPR103W 864 nt3.08□□□□□ -1.92
USB1Q12208 FYV5YCL058C 459 nt3.08□□□□□ -1.92
USB1Q12208 ARO9YHR137W 1542 nt3.08□□□□□ -1.92
USB1Q12208 ELM1YKL048C 1923 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 ERJ5YFR041C 888 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 FOL2YGR267C 732 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 COS8YHL048W 1146 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 ANB1YJR047C 474 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 TVP18YMR071C 504 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 NCE103YNL036W 666 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 RPC34YNR003C 954 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 MET16YPR167C 786 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 RKM4YDR257C 1485 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 MEK1YOR351C 1494 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 PRM15YMR278W 1869 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 STT4YLR305C 5703 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 DAP2YHR028C 2457 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 VPS53YJL029C 2469 nt3.07□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YDR271CYDR271C 372 nt3.06□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YDR282CYDR282C 1245 nt3.06□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.06□□□□□ -1.92
USB1Q12208 MMS2YGL087C 414 nt3.06□□□□□ -1.92
USB1Q12208 MRT4YKL009W 711 nt3.06□□□□□ -1.92
USB1Q12208 HMX1YLR205C 954 nt3.06□□□□□ -1.92
USB1Q12208 ERD2YBL040C 660 nt3.06□□□□□ -1.92
USB1Q12208 RIM11YMR139W 1113 nt3.06□□□□□ -1.92
USB1Q12208 MOH1YBL049W 417 nt3.06□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YPR077CYPR077C 372 nt3.06□□□□□ -1.92
USB1Q12208 TAF1YGR274C 3201 nt3.06□□□□□ -1.92
USB1Q12208 EPO1YMR124W 2832 nt3.06□□□□□ -1.92
USB1Q12208 IME4YGL192W 1803 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 MRH4YGL064C 1686 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 SET1YHR119W 3243 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 OSH3YHR073W 2991 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 ATG21YPL100W 1491 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 HOS2YGL194C 1359 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YER137C-AYER137C-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YER159C-AYER159C-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YJR026WYJR026W 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YJR028WYJR028W 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YAR010CYAR010C 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms