Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc162pQ0VG85 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc162pQ0VG85 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms