Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms