Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NeblQ0II04 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NeblQ0II04 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms