Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn2Q08093 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms