Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN12Q05209 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms