Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms