Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CkbQ04447 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CkbQ04447 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CkbQ04447 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CkbQ04447 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CkbQ04447 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CkbQ04447 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CkbQ04447 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms