Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms