Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms