Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gja5Q01231 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja5Q01231 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms