Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba2P98084 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba2P98084 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba2P98084 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba2P98084 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba2P98084 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba2P98084 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba2P98084 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba2P98084 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apba2P98084 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apba2P98084 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba2P98084 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba2P98084 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms