Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarcc1P97496 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms