Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms