Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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