Protein–RNA interactions for Protein: P63277

Amelx, Amelogenin, X isoform, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmelxP63277 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmelxP63277 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmelxP63277 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmelxP63277 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmelxP63277 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmelxP63277 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmelxP63277 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmelxP63277 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmelxP63277 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmelxP63277 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmelxP63277 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmelxP63277 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmelxP63277 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmelxP63277 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmelxP63277 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmelxP63277 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms