Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gnb1P62874 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gnb1P62874 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnb1P62874 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnb1P62874 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnb1P62874 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnb1P62874 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnb1P62874 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnb1P62874 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnb1P62874 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms