Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl23aP62751 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms