Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vbp1P61759 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms