Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smg6P61406 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smg6P61406 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smg6P61406 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg6P61406 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms