Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PlnP61014 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PlnP61014 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PlnP61014 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PlnP61014 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PlnP61014 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PlnP61014 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PlnP61014 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PlnP61014 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PlnP61014 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PlnP61014 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PlnP61014 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PlnP61014 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PlnP61014 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PlnP61014 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PlnP61014 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PlnP61014 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PlnP61014 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PlnP61014 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PlnP61014 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PlnP61014 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PlnP61014 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PlnP61014 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PlnP61014 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PlnP61014 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PlnP61014 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PlnP61014 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PlnP61014 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PlnP61014 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms