Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms