Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp5P56399 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp5P56399 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp5P56399 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp5P56399 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp5P56399 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp5P56399 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp5P56399 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp5P56399 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms