Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab4aP56371 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab4aP56371 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab4aP56371 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab4aP56371 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab4aP56371 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms